Sauber lleva desde los años 70 construyendo coches deportivos. En 1989 consiguieron ganar las 24 Horas de Le Mans y el Campeonato Mundial de Resistencia en 1989 y 1990 superando a Porsche y Jaguar. Entre sus mayores figuras; Michael Schumacher, Karl Wendlinger, Jochen Mass y Mauro Baldi han defendido los colores de Sauber. El primer Sauber, el C1, fue construido en 1970.

Sus primeros años fueron de constante cambio de motores; comenzaron con Ilmor, Mercedes y más tarde Ford. Finalmente llegaron a un acuerdo con Ferrari y el importante patrocinio de la petrolera malaya Petronas en 1996. El acuerdo con la 'scuderia del cabalinho rampante' provocó que se extendieran los rumores de que Sauber era el "equipo de pruebas" de Ferrari.

A pesar de los esfuerzos invertidos sus mejores resultados fueron seis terceros lugares y dos salidas en la primera fila de la parrilla de salida. Del equipo salieron varios pilotos de renombre como Heinz-Harald Frentzen, Nick Heidfeld, Kimi Raikkonen o Felipe Massa.

En 2005, BMW compró el equipo para pasar a denominarse BMW Sauber, la adquisición no supuso grandes cambios. El 8 de junio de 2008, BMW consiguió su primera victoria gracias al polaco Robert Kubica en el Gran Premio de Canadá.

El 29 de julio de 2009, BMW Sauber anunció su retirada del Mundial de F1 al final de temporada. BMW puso en venta al equipo. En 2010 Sauber se inscribió para la temporada 2010 utilizando motor y transimisiones de Ferrari y nuevamente con Peter Sauber como director del equipo.

El 3 de diciembre de 2009, la FIA anunció que Sauber ocuparía la plaza libre de Toyota. El día 3 de enero de 2010 surgió la primicia de que Pedro Martínez de la Rosa sería el compañero de equipo de Kobayashi al mando del segundo monoplaza de la escudería de Hinwil.

El 4 de octubre de 2010, se anunció que el piloto mexicano, Sergio Pérez Mendoza, competiría en la temporada 2011 de Fórmula 1 con el equipo junto con Kamui Kobayashi. El 28 de julio de 2011 el Sauber F1 Team confirma a sus tres pilotos para la temporada 2012 de Fórmula 1: "Checo" Pérez, Kamui Kobayashi y Esteban Gutiérrez como piloto de pruebas y de reserva.

En 2012, la escudería suiza prácticamente triplicó los puntos respecto a la campaña anterior, logrando cuatro podios que le auparon a la sexta plaza del Mundial de Constructores. En 2013 Monisha Kaltenborn será la primera jefa de equipo de la F1. Además, Pérez y Kobayashi no continuarán en el equipo y la nueva alineación para 2013 la formarán Nico Hulkenberg y Esteban Gutiérrez.