A lo largo de estos capítulos se han ido aclarando y creando nuevas incógnitas que giran en torno a los maquiavélicos personajes de El Internado.
Al principio de la temporada descubrimos los orígenes de Camilo. El profesor de latín ha estado involucrado en el proyecto géminis desde el principio pero, hasta ahora, desconocíamos sus razones. Hemos podido descubrir que su padre era un general nazi y que, antes de morir, envió a su hijo al orfanato Laguna Negra desde Alemania durante los últimos días del imperio nazi. Allí quedó al cargo de Don Joaquín, quien le inculcó desde niño la ideología nazi.
En el segundo episodio de la temporada pudimos conocer a Lucía, una brillante médico que trabaja para Ottox y que será la encargada de suministrar a Héctor un tratamiento experimental capaz de combatir un extraño virus que padece el ex director de La Laguna Negra. Héctor descubre algo de ella que hará que se quede impactado, Lucía es en realidad la cuarta huérfana y está compinchada con Camilo y Noiret en contra de su voluntad. Un año antes había recibido la inesperada visita de Irene Espí, antigua compañera suya del orfanato a quien no recordaba. Ella fue la encargada de explicarle todo lo relacionado con Ottox y el proyecto géminis. Cuando Lucía se disponía a denunciar a Ottox, Santiago Pazos la inyectó un virus letal del que ella tenía que encontrar una cura, por esa razón está a merced de ellos.
Además, Lucía tuvo un inesperado problema, al conocer a Héctor se quedó prendada de sus encantos y lo mismo le ocurrió a él. Esta relación no hacía más que entorpecer la misión de la doctora en el Internado, por eso, intentó apartarse de él, aunque no pudo.
Un misterio que se ha resuelto es el del suicidio de Valentina, la madre adoptiva de Iván. Desde el principio de la serie se pensó que se había suicidado cuando se enteró de que su hijo lo había comprado Noiret, pero fue éste en realidad quien la ahogó en la bañera para que no contara la verdad.
Una de las grandes sorpresas de estos capítulos es la aparición de Santiago Pazos, padre de Irene Espí y abuelo de Marcos y Paula, a quien se le daba por muerto. Este hombre es en realidad Ritter Wulf, uno de los nazis que escaparon de Alemania fingiendo su muerte y que cambiaron de identidad.
Otro giro de la temporada que ha causado un gran impacto ha sido el del personaje de Hugo. El nuevo profesor de gimnasia, antiguo alumno del internado y, aparentemente, amigo de Héctor, es en realidad un personaje oscuro que está al corriente de todo el proyecto géminis y que, por razones desconocidas, es temido por Noiret y Camilo. Hugo es el responsable de que María volviera al Psiquiátrico.
En el último capítulo de la temporada las cosas no les sale a Noiret y a Camilo como esperaban, el primero es despedido del internado por Elsa, y el segundo arde en llamas cuando intentaba matar a Fermín.
¿Qué crees que les pasará en la próxima temporada? ¿Qué te ha parecido todo lo que hemos descubierto de ellos?